Wojny klonów przetaczają się przez galaktykę, a bohaterscy rycerze Jedi walczą o utrzymanie ładu i przywrócenie pokoju. Kolejne systemy padają ofiarą sił ciemnej strony Mocy, a coraz większą kontrolę nad Galaktyczną Republiką obejmują Separatyści i ich niezliczona armia droidów.
Anakin Skywalker i towarzysząca mu jako padawan – czyli młoda adeptka Jedi – Ahsoka Tano wyruszają z misją, której konsekwencje okażą się bardzo dalekosiężne. Muszą oni między innymi stanąć twarzą w twarz z bossem kosmicznej mafii Jabbą Huttem. Jednak Hrabia Dooku i jego groźni agenci z podstępną Asajj Ventress na czele nie cofną się przed niczym, aby pokrzyżować plany Anakina i Ashoki.
Tymczasem na liniach frontu Obi-Wan Kenobi i Mistrz Yoda dowodzą niezliczoną armią klonów, podejmując heroiczną próbę oporu przed siłami ciemnej strony Mocy...